ゲノムの塩基配列は交雑，組み換え，共生，感染，水平転移などの様々な要因によって不断に変化しています。そのような変異の中には，エピゲノムの変動を介して植物の多様性や進化に影響を与えるものがあります。また，このようなゲノムの進化は多種多様な低分子化合物を生成する代謝経路の発達につながります。植物の持つ多様な二次代謝物群は，植物の生長や発達に必要なだけでなく，私たちにとっては医薬品の原料としてもとても重要です。

　本研究室では，シロイヌナズナなどの植物を用いた実験的なアプローチと，様々なオミクスデータの解析手法の開発やデータベースの開発といったデータサイエンスの両面から研究を行なっています。具体的には，DNAの切断・修復によって引き起こされるゲノム・エピゲノムの変動メカニズム，植物のゲノム・エピゲノムの進化およびゲノム系統解析，AI / 機械学習および新規オミクスデータ解析法の開発，データドリブンな知識体系化および情報統合，京都発のデータベース開発 といった課題に取り組んでいます。